Existen diferentes Encefalomielitis Equinas, que se denominan Este, Oeste y Venezuela (esta última nunca tuvo registro en nuestro país). Es la del Oeste la que se aisló en el año 1988, según consta en archivos, y esta misma se halló en los casos positivos de Alphavirus en equinos que fueron notificados por SENASA en las vecinas provincias de Corrientes y Santa Fe.
La enfermedad se transmite a través de dos tipos de mosquitos que son rurales (no se encuentran en zonas urbanas), cuyos nombres son: Culex spp. y Culiseta spp. La forma en que el mosquito transmite la enfermedad es picando a un ave o pequeños roedores silvestres, reservorios del virus; a su vez, este mismo mosquito puede picar a un caballo o a una persona, infectándola.
Para prevenir la Encefalomielitis por Alphavirus se recomiendan las siguientes medidas: control de mosquitos para evitar la diseminación de la enfermedad y el contagio (se debe tener en cuenta que para la aplicación de productos en animales y ambientes deben utilizarse aquellos que estén autorizados por SENASA); utilizar repelentes; correcta vacunación de los equinos.